Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SG52

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SG52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SG52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SG52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SG52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SG52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0D9SG52 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A0D9SG52 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0D9SG52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SG52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0D9SG52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0D9SG52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SG52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0D9SG52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A0D9SG52 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0D9SG52 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A0D9SG52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A0D9SG52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0D9SG52 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0D9SG52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms