Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIPK3Q9H422 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIPK3Q9H422 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIPK3Q9H422 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HIPK3Q9H422 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HIPK3Q9H422 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms