Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LINC00116Q8NCU8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
LINC00116Q8NCU8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LINC00116Q8NCU8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms