Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LYSMD4Q5XG99 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYSMD4Q5XG99 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms