Protein–RNA interactions for Protein: P54296

MYOM2, Myomesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM2P54296 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MYOM2P54296 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYOM2P54296 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYOM2P54296 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms