Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SPAG9O60271 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SPAG9O60271 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPAG9O60271 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms