Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD9AQ99638 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD9AQ99638 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD9AQ99638 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms