Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SIRT1Q96EB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SIRT1Q96EB6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms