Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYSMD4Q5XG99 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LYSMD4Q5XG99 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms