Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SIK1P57059 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SIK1P57059 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SIK1P57059 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SIK1P57059 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SIK1P57059 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SIK1P57059 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SIK1P57059 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SIK1P57059 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SIK1P57059 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SIK1P57059 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SIK1P57059 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIK1P57059 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIK1P57059 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SIK1P57059 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms