Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPEF1O14829 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPEF1O14829 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms