Protein–RNA interactions for Protein: Q9H598

SLC32A1, Vesicular inhibitory amino acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC32A1Q9H598 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC32A1Q9H598 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC32A1Q9H598 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC32A1Q9H598 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC32A1Q9H598 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC32A1Q9H598 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC32A1Q9H598 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC32A1Q9H598 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.6 ms