Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TOX2Q96NM4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TOX2Q96NM4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TOX2Q96NM4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms