Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM199Q8N511 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM199Q8N511 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms