Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D2Q14995 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NR1D2Q14995 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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