Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPNMBQ14956 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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