Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSFQ9UBX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CTSFQ9UBX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSFQ9UBX1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSFQ9UBX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSFQ9UBX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTSFQ9UBX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms