RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379772.3

C20orf27-202, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C20orf27, Length 1,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-202ENST00000379772 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.13■■■■■ 6.26
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C20orf27-202ENST00000379772 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.03■■■■■ 4.8
C20orf27-202ENST00000379772 NACADO15069 1562 aa45.02■■■■■ 4.8
C20orf27-202ENST00000379772 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.75■■■■■ 4.75
C20orf27-202ENST00000379772 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.69■■■■■ 4.74
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C20orf27-202ENST00000379772 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.63
C20orf27-202ENST00000379772 SCRIBQ14160 1630 aa43.88■■■■■ 4.61
C20orf27-202ENST00000379772 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.68■■■■■ 4.58
C20orf27-202ENST00000379772 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.17■■■■■ 4.5
C20orf27-202ENST00000379772 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.91■■■■■ 4.46
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C20orf27-202ENST00000379772 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.31■■■■■ 4.36
C20orf27-202ENST00000379772 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.25■■■■■ 4.35
C20orf27-202ENST00000379772 SMARCA4P51532 1647 aa41.91■■■■■ 4.3
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C20orf27-202ENST00000379772 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.69■■■■■ 4.26
C20orf27-202ENST00000379772 NCAPD3P42695 1498 aa41.59■■■■■ 4.25
C20orf27-202ENST00000379772 SMARCA2P51531 1590 aa41.58■■■■■ 4.25
C20orf27-202ENST00000379772 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.43■■■■■ 4.22
C20orf27-202ENST00000379772 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
C20orf27-202ENST00000379772 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
C20orf27-202ENST00000379772 WIZO95785 1651 aa41.34■■■■■ 4.21
C20orf27-202ENST00000379772 HMGXB3Q12766 1538 aa41.33■■■■■ 4.21
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C20orf27-202ENST00000379772 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.46■■■■■ 4.07
C20orf27-202ENST00000379772 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.41■■■■■ 4.06
C20orf27-202ENST00000379772 ERCC6Q03468 1493 aa40.35■■■■■ 4.05
C20orf27-202ENST00000379772 CFTRP13569 1480 aa40.22■■■■■ 4.03
C20orf27-202ENST00000379772 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.21■■■■■ 4.03
C20orf27-202ENST00000379772 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.03■■■■■ 4
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C20orf27-202ENST00000379772 PRDM2Q13029 1718 aa39.85■■■■□ 3.97
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C20orf27-202ENST00000379772 CUX2O14529 1486 aa39.7■■■■□ 3.95
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C20orf27-202ENST00000379772 ABCC8Q09428 1581 aa39.3■■■■□ 3.88
C20orf27-202ENST00000379772 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.27■■■■□ 3.88
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C20orf27-202ENST00000379772 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
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C20orf27-202ENST00000379772 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
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C20orf27-202ENST00000379772 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.86■■■■□ 3.81
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C20orf27-202ENST00000379772 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.46■■■■□ 3.75
C20orf27-202ENST00000379772 GRIN2BQ13224 1484 aa38.39■■■■□ 3.74
C20orf27-202ENST00000379772 FBLN2P98095 1184 aa38.39■■■■□ 3.74
C20orf27-202ENST00000379772 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.37■■■■□ 3.73
C20orf27-202ENST00000379772 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.36■■■■□ 3.73
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C20orf27-202ENST00000379772 OSCARQ8IYS5 282 aa38.3■■■■□ 3.72
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C20orf27-202ENST00000379772 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
C20orf27-202ENST00000379772 NUP160Q12769 1436 aa37.69■■■■□ 3.62
C20orf27-202ENST00000379772 CEP170Q5SW79 1584 aa37.69■■■■□ 3.62
C20orf27-202ENST00000379772 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.69■■■■□ 3.62
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C20orf27-202ENST00000379772 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.65■■■■□ 3.62
C20orf27-202ENST00000379772 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.58■■■■□ 3.61
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C20orf27-202ENST00000379772 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
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