Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SREBF2Q12772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SREBF2Q12772 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SREBF2Q12772 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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