Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNIKQ9UKE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNIKQ9UKE5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNIKQ9UKE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms