Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIMS1Q86UR5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMS1Q86UR5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMS1Q86UR5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms