Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SP3Q02447 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SP3Q02447 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SP3Q02447 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP3Q02447 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP3Q02447 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP3Q02447 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SP3Q02447 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP3Q02447 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP3Q02447 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SP3Q02447 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SP3Q02447 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SP3Q02447 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP3Q02447 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SP3Q02447 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SP3Q02447 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP3Q02447 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP3Q02447 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP3Q02447 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP3Q02447 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SP3Q02447 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP3Q02447 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP3Q02447 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP3Q02447 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SP3Q02447 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SP3Q02447 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms