Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP5A1P25705 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP5A1P25705 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms