Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RUNX2Q13950 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RUNX2Q13950 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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