Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 36.27□□□□□ -1.413e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 25.11□□□□□ -1.593e-11■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.874e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 511.98□□□□□ -0.494e-8■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.383e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-206ENST00000494752 789 ntTSL 310.8□□□□□ -0.683e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.93e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 DPM1-205ENST00000466152 1097 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.163e-12■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 MUM1-203ENST00000586067 500 ntTSL 426.7■■□□□ 1.867e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-207ENST00000588888 1264 ntTSL 322.7■■□□□ 1.227e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-212ENST00000591453 2453 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.77e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-207ENST00000543714 567 ntTSL 217.02■□□□□ 0.327e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-205ENST00000587460 2793 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.37e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-213ENST00000591627 1461 ntTSL 215.62■□□□□ 0.097e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 OSBP2-206ENST00000431368 3050 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-16■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CHD4-203ENST00000535717 660 ntTSL 214.2□□□□□ -0.147e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-203ENST00000539330 608 ntTSL 212.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-205ENST00000541027 536 ntTSL 412.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 UCP2-206ENST00000542615 538 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PRR13-208ENST00000549740 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.377e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MUM1-214ENST00000591806 4067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.467e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.937e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-206ENST00000479235 3121 ntTSL 26.61□□□□□ -1.357e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 GPBP1L1-204ENST00000467032 592 ntTSL 24.89□□□□□ -1.637e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.633e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-202ENST00000417736 2163 ntTSL 227.35■■□□□ 1.973e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.523e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TUBB6-204ENST00000586691 359 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-13■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.674e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 TMEM97-204ENST00000582384 1075 ntTSL 314.65□□□□□ -0.064e-9■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MED15-220ENST00000461076 826 ntTSL 316.22■□□□□ 0.193e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.812e-26■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-208ENST00000564966 1122 ntTSL 230.84■■■□□ 2.533e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-206ENST00000563597 815 ntTSL 330.03■■■□□ 2.43e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-213ENST00000568810 1080 ntTSL 230.03■■■□□ 2.43e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-212ENST00000567828 742 ntTSL 327.55■■■□□ 23e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-211ENST00000567642 658 ntTSL 225.46■■□□□ 1.673e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-208ENST00000566515 1634 ntTSL 524.75■■□□□ 1.553e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PPP4C-210ENST00000567040 879 ntTSL 221.34■■□□□ 1.013e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.933e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-204ENST00000563065 1450 ntTSL 220.59■□□□□ 0.893e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-215ENST00000569745 1356 ntTSL 519.75■□□□□ 0.753e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-201ENST00000460601 2137 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.637e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 218.2■□□□□ 0.53e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.497e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MED15-212ENST00000436496 393 ntTSL 317.67■□□□□ 0.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.313e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-205ENST00000477741 2070 ntTSL 1 (best)16.26■□□□□ 0.197e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-206ENST00000565296 1831 ntTSL 216.26■□□□□ 0.193e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-209ENST00000486263 708 ntTSL 216.11■□□□□ 0.177e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.133e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-204ENST00000474543 2047 ntTSL 515.73■□□□□ 0.117e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-208ENST00000535459 581 ntTSL 214.57□□□□□ -0.083e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-207ENST00000479207 1112 ntTSL 313.74□□□□□ -0.217e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 ATP5F1-205ENST00000483994 678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.377e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.387e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-203ENST00000367055 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.413e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 312.41□□□□□ -0.427e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-216ENST00000546260 4302 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-202ENST00000444658 1479 ntTSL 210.44□□□□□ -0.743e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.747e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NELFCD-206ENST00000478389 3581 ntTSL 29.01□□□□□ -0.977e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-213ENST00000541573 573 ntTSL 48.06□□□□□ -1.123e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.123e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 CCNDBP1-207ENST00000565958 750 ntTSL 26.99□□□□□ -1.293e-14■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.37e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MRPL42-209ENST00000552326 567 ntTSL 46.77□□□□□ -1.337e-10■□□□□ 8.1
PABPC4Q13310 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.284e-10■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.092e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-201ENST00000254636 2613 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 IMMT-205ENST00000419070 2172 ntTSL 58.22□□□□□ -1.092e-15■□□□□ 8
PABPC4Q13310 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.327e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.67e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 525■■□□□ 1.593e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.394e-7■□□□□ 8
PABPC4Q13310 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.383e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.142e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.035e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.965e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.855e-8■□□□□ 8
PABPC4Q13310 NQO2-207ENST00000397717 833 ntTSL 520.02■□□□□ 0.87e-6■□□□□ 8
PABPC4Q13310 PSMA1-212ENST00000532256 588 ntTSL 219.79■□□□□ 0.761e-7■□□□□ 8
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 697.5 ms