RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.69■■■■■ 7.63
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.09■■■■■ 6.57
PPP4C-208ENST00000564966 ABCC9O60706 1549 aa55.92■■■■■ 6.54
PPP4C-208ENST00000564966 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.31■■■■■ 6.12
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.09■■■■■ 6.09
PPP4C-208ENST00000564966 NACADO15069 1562 aa52.97■■■■■ 6.07
PPP4C-208ENST00000564966 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.24■■■■■ 5.95
PPP4C-208ENST00000564966 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.15■■■■■ 5.94
PPP4C-208ENST00000564966 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.05■■■■■ 5.92
PPP4C-208ENST00000564966 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.04■■■■■ 5.92
PPP4C-208ENST00000564966 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.01■■■■■ 5.92
PPP4C-208ENST00000564966 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.72■■■■■ 5.87
PPP4C-208ENST00000564966 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.64■■■■■ 5.86
PPP4C-208ENST00000564966 SCRIBQ14160 1630 aa51.27■■■■■ 5.8
PPP4C-208ENST00000564966 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.97■■■■■ 5.75
PPP4C-208ENST00000564966 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.46■■■■■ 5.67
PPP4C-208ENST00000564966 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.42■■■■■ 5.66
PPP4C-208ENST00000564966 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.31■■■■■ 5.64
PPP4C-208ENST00000564966 NCAPD3P42695 1498 aa48.86■■■■■ 5.41
PPP4C-208ENST00000564966 SMARCA4P51532 1647 aa48.86■■■■■ 5.41
PPP4C-208ENST00000564966 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.8■■■■■ 5.4
PPP4C-208ENST00000564966 SMARCA2P51531 1590 aa48.72■■■■■ 5.39
PPP4C-208ENST00000564966 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
PPP4C-208ENST00000564966 HMGXB3Q12766 1538 aa48.55■■■■■ 5.36
PPP4C-208ENST00000564966 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
PPP4C-208ENST00000564966 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.33■■■■■ 5.33
PPP4C-208ENST00000564966 ERCC6Q03468 1493 aa48.32■■■■■ 5.33
PPP4C-208ENST00000564966 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.28■■■■■ 5.32
PPP4C-208ENST00000564966 NESP48681 1621 aa48.09■■■■■ 5.29
PPP4C-208ENST00000564966 CUX2O14529 1486 aa47.97■■■■■ 5.27
PPP4C-208ENST00000564966 WIZO95785 1651 aa47.8■■■■■ 5.24
PPP4C-208ENST00000564966 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.76■■■■■ 5.24
PPP4C-208ENST00000564966 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP4C-208ENST00000564966 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.53■■■■■ 5.2
PPP4C-208ENST00000564966 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.48■■■■■ 5.19
PPP4C-208ENST00000564966 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
PPP4C-208ENST00000564966 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.46■■■■■ 5.19
PPP4C-208ENST00000564966 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.18
PPP4C-208ENST00000564966 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
PPP4C-208ENST00000564966 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.08■■■■■ 5.13
PPP4C-208ENST00000564966 CEP164Q9UPV0 1460 aa47■■■■■ 5.11
PPP4C-208ENST00000564966 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.95■■■■■ 5.11
PPP4C-208ENST00000564966 CFTRP13569 1480 aa46.95■■■■■ 5.11
PPP4C-208ENST00000564966 WDR62O43379 1518 aa46.9■■■■■ 5.1
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.67■■■■■ 5.06
PPP4C-208ENST00000564966 PRDM2Q13029 1718 aa46.53■■■■■ 5.04
PPP4C-208ENST00000564966 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.51■■■■■ 5.04
PPP4C-208ENST00000564966 TOPBP1Q92547 1522 aa46.08■■■■■ 4.97
PPP4C-208ENST00000564966 IFT140Q96RY7 1462 aa46.01■■■■■ 4.96
PPP4C-208ENST00000564966 ABCC8Q09428 1581 aa46.01■■■■■ 4.96
PPP4C-208ENST00000564966 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.94■■■■■ 4.94
PPP4C-208ENST00000564966 OSCARQ8IYS5 282 aa45.93■■■■■ 4.94
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
PPP4C-208ENST00000564966 TRIM41Q8WV44 630 aa45.86■■■■■ 4.93
PPP4C-208ENST00000564966 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
PPP4C-208ENST00000564966 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
PPP4C-208ENST00000564966 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
PPP4C-208ENST00000564966 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
PPP4C-208ENST00000564966 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.56■■■■■ 4.888e-7■■■■■ 28.9
PPP4C-208ENST00000564966 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.49■■■■■ 4.87
PPP4C-208ENST00000564966 SOGA1O94964 1423 aa45.47■■■■■ 4.87
PPP4C-208ENST00000564966 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.42■■■■■ 4.86
PPP4C-208ENST00000564966 CUX1P39880 1505 aa45.39■■■■■ 4.86
PPP4C-208ENST00000564966 FBLN2P98095 1184 aa45.37■■■■■ 4.85
PPP4C-208ENST00000564966 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
PPP4C-208ENST00000564966 CHD1O14646 1710 aa45.29■■■■■ 4.84
PPP4C-208ENST00000564966 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.24■■■■■ 4.83
PPP4C-208ENST00000564966 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.24■■■■■ 4.83
PPP4C-208ENST00000564966 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.24■■■■■ 4.83
PPP4C-208ENST00000564966 WDR97A6NE52 1622 aa45.14■■■■■ 4.82
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF11O15085 1522 aa45.13■■■■■ 4.82
PPP4C-208ENST00000564966 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.11■■■■■ 4.81
PPP4C-208ENST00000564966 GRIN2BQ13224 1484 aa45.02■■■■■ 4.8
PPP4C-208ENST00000564966 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
PPP4C-208ENST00000564966 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
PPP4C-208ENST00000564966 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.91■■■■■ 4.78
PPP4C-208ENST00000564966 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.89■■■■■ 4.78
PPP4C-208ENST00000564966 PBRM1Q86U86 1689 aa44.87■■■■■ 4.77
PPP4C-208ENST00000564966 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.86■■■■■ 4.77
PPP4C-208ENST00000564966 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.83■■■■■ 4.77
PPP4C-208ENST00000564966 SYNJ2O15056 1496 aa44.82■■■■■ 4.77
PPP4C-208ENST00000564966 SYNJ1O43426 1573 aa44.8■■■■■ 4.76
PPP4C-208ENST00000564966 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.76■■■■■ 4.76
PPP4C-208ENST00000564966 TOP2BQ02880 1626 aa44.75■■■■■ 4.75
PPP4C-208ENST00000564966 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.74■■■■■ 4.75
PPP4C-208ENST00000564966 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.7■■■■■ 4.75
PPP4C-208ENST00000564966 ARAP1Q96P48 1450 aa44.69■■■■■ 4.74
PPP4C-208ENST00000564966 ADAMTS12P58397 1594 aa44.43■■■■■ 4.7
PPP4C-208ENST00000564966 GRIN2AQ12879 1464 aa44.43■■■■■ 4.7
PPP4C-208ENST00000564966 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.7
PPP4C-208ENST00000564966 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.34■■■■■ 4.69
PPP4C-208ENST00000564966 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.32■■■■■ 4.69
PPP4C-208ENST00000564966 CEP170Q5SW79 1584 aa44.24■■■■■ 4.67
PPP4C-208ENST00000564966 NUP160Q12769 1436 aa44.21■■■■■ 4.67
PPP4C-208ENST00000564966 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.07■■■■■ 4.65
PPP4C-208ENST00000564966 KIF27Q86VH2 1401 aa43.97■■■■■ 4.63
PPP4C-208ENST00000564966 SHROOM2Q13796 1616 aa43.95■■■■■ 4.63
PPP4C-208ENST00000564966 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PPP4C-208ENST00000564966 JPH4Q96JJ6 628 aa43.85■■■■■ 4.61
PPP4C-208ENST00000564966 IGF1RP08069 1367 aa43.83■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms