RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.49■■■■■ 6.63
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.62■■■■■ 5.69
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC9O60706 1549 aa50.16■■■■■ 5.62
PPP4C-212ENST00000567828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.94■■■■■ 5.26
PPP4C-212ENST00000567828 NACADO15069 1562 aa47.67■■■■■ 5.22
PPP4C-212ENST00000567828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.44■■■■■ 5.18
PPP4C-212ENST00000567828 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.1■■■■■ 5.13
PPP4C-212ENST00000567828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.05■■■■■ 5.12
PPP4C-212ENST00000567828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
PPP4C-212ENST00000567828 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.7■■■■■ 5.07
PPP4C-212ENST00000567828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.67■■■■■ 5.06
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.62■■■■■ 5.05
PPP4C-212ENST00000567828 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.56■■■■■ 5.04
PPP4C-212ENST00000567828 SCRIBQ14160 1630 aa46.16■■■■■ 4.98
PPP4C-212ENST00000567828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.87■■■■■ 4.93
PPP4C-212ENST00000567828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.37■■■■■ 4.85
PPP4C-212ENST00000567828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.36■■■■■ 4.85
PPP4C-212ENST00000567828 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.11■■■■■ 4.81
PPP4C-212ENST00000567828 SMARCA4P51532 1647 aa44.06■■■■■ 4.64
PPP4C-212ENST00000567828 NCAPD3P42695 1498 aa43.95■■■■■ 4.63
PPP4C-212ENST00000567828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.91■■■■■ 4.62
PPP4C-212ENST00000567828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
PPP4C-212ENST00000567828 SMARCA2P51531 1590 aa43.84■■■■■ 4.61
PPP4C-212ENST00000567828 HMGXB3Q12766 1538 aa43.74■■■■■ 4.59
PPP4C-212ENST00000567828 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.58■■■■■ 4.57
PPP4C-212ENST00000567828 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.56■■■■■ 4.56
PPP4C-212ENST00000567828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
PPP4C-212ENST00000567828 ERCC6Q03468 1493 aa43.26■■■■■ 4.52
PPP4C-212ENST00000567828 NESP48681 1621 aa43.22■■■■■ 4.51
PPP4C-212ENST00000567828 WIZO95785 1651 aa43.14■■■■■ 4.5
PPP4C-212ENST00000567828 CUX2O14529 1486 aa43.03■■■■■ 4.48
PPP4C-212ENST00000567828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.99■■■■■ 4.47
PPP4C-212ENST00000567828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.81■■■■■ 4.44
PPP4C-212ENST00000567828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
PPP4C-212ENST00000567828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
PPP4C-212ENST00000567828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.63■■■■■ 4.42
PPP4C-212ENST00000567828 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.63■■■■■ 4.41
PPP4C-212ENST00000567828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.47■■■■■ 4.39
PPP4C-212ENST00000567828 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.3■■■■■ 4.36
PPP4C-212ENST00000567828 CFTRP13569 1480 aa42.25■■■■■ 4.35
PPP4C-212ENST00000567828 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
PPP4C-212ENST00000567828 WDR62O43379 1518 aa42.2■■■■■ 4.35
PPP4C-212ENST00000567828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.2■■■■■ 4.35
PPP4C-212ENST00000567828 PRDM2Q13029 1718 aa42.11■■■■■ 4.33
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.03■■■■■ 4.32
PPP4C-212ENST00000567828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PPP4C-212ENST00000567828 TOPBP1Q92547 1522 aa41.46■■■■■ 4.23
PPP4C-212ENST00000567828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.37■■■■■ 4.21
PPP4C-212ENST00000567828 ABCC8Q09428 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
PPP4C-212ENST00000567828 IFT140Q96RY7 1462 aa41.33■■■■■ 4.21
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
PPP4C-212ENST00000567828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PPP4C-212ENST00000567828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
PPP4C-212ENST00000567828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
PPP4C-212ENST00000567828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
PPP4C-212ENST00000567828 OSCARQ8IYS5 282 aa41.05■■■■■ 4.16
PPP4C-212ENST00000567828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.92■■■■■ 4.143e-7■■■■■ 28.9
PPP4C-212ENST00000567828 CUX1P39880 1505 aa40.92■■■■■ 4.14
PPP4C-212ENST00000567828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.9■■■■■ 4.14
PPP4C-212ENST00000567828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
PPP4C-212ENST00000567828 TRIM41Q8WV44 630 aa40.85■■■■■ 4.13
PPP4C-212ENST00000567828 CHD1O14646 1710 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-212ENST00000567828 SOGA1O94964 1423 aa40.83■■■■■ 4.13
PPP4C-212ENST00000567828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
PPP4C-212ENST00000567828 WDR97A6NE52 1622 aa40.69■■■■■ 4.1
PPP4C-212ENST00000567828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP4C-212ENST00000567828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP4C-212ENST00000567828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
PPP4C-212ENST00000567828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.54■■■■■ 4.08
PPP4C-212ENST00000567828 FBLN2P98095 1184 aa40.53■■■■■ 4.08
PPP4C-212ENST00000567828 ARHGEF11O15085 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
PPP4C-212ENST00000567828 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
PPP4C-212ENST00000567828 GRIN2BQ13224 1484 aa40.45■■■■■ 4.07
PPP4C-212ENST00000567828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.42■■■■■ 4.06
PPP4C-212ENST00000567828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
PPP4C-212ENST00000567828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.41■■■■■ 4.06
PPP4C-212ENST00000567828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4C-212ENST00000567828 TOP2BQ02880 1626 aa40.38■■■■■ 4.06
PPP4C-212ENST00000567828 SYNJ1O43426 1573 aa40.38■■■■■ 4.05
PPP4C-212ENST00000567828 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.38■■■■■ 4.05
PPP4C-212ENST00000567828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.33■■■■■ 4.05
PPP4C-212ENST00000567828 SYNJ2O15056 1496 aa40.28■■■■■ 4.04
PPP4C-212ENST00000567828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
PPP4C-212ENST00000567828 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.25■■■■■ 4.03
PPP4C-212ENST00000567828 ARAP1Q96P48 1450 aa40.14■■■■■ 4.02
PPP4C-212ENST00000567828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.1■■■■■ 4.01
PPP4C-212ENST00000567828 ADAMTS12P58397 1594 aa40.06■■■■■ 4
PPP4C-212ENST00000567828 GRIN2AQ12879 1464 aa39.96■■■■□ 3.99
PPP4C-212ENST00000567828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.92■■■■□ 3.98
PPP4C-212ENST00000567828 CEP170Q5SW79 1584 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP4C-212ENST00000567828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.85■■■■□ 3.97
PPP4C-212ENST00000567828 NUP160Q12769 1436 aa39.78■■■■□ 3.96
PPP4C-212ENST00000567828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.68■■■■□ 3.94
PPP4C-212ENST00000567828 SHROOM2Q13796 1616 aa39.65■■■■□ 3.94
PPP4C-212ENST00000567828 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-212ENST00000567828 KIF27Q86VH2 1401 aa39.51■■■■□ 3.92
PPP4C-212ENST00000567828 CUL7Q14999 1698 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP4C-212ENST00000567828 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.49■■■■□ 3.91
PPP4C-212ENST00000567828 IGF1RP08069 1367 aa39.43■■■■□ 3.9
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