RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.93■■■■■ 5.9
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.5■■■■■ 5.04
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC9O60706 1549 aa46.2■■■■■ 4.99
PPP4C-211ENST00000567642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.11■■■■■ 4.65
PPP4C-211ENST00000567642 NACADO15069 1562 aa43.86■■■■■ 4.61
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.82■■■■■ 4.61
PPP4C-211ENST00000567642 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.27■■■■■ 4.52
PPP4C-211ENST00000567642 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.21■■■■■ 4.51
PPP4C-211ENST00000567642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
PPP4C-211ENST00000567642 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.99■■■■■ 4.47
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.87■■■■■ 4.45
PPP4C-211ENST00000567642 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.78■■■■■ 4.44
PPP4C-211ENST00000567642 SCRIBQ14160 1630 aa42.44■■■■■ 4.38
PPP4C-211ENST00000567642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
PPP4C-211ENST00000567642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.76■■■■■ 4.28
PPP4C-211ENST00000567642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
PPP4C-211ENST00000567642 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCA4P51532 1647 aa40.48■■■■■ 4.07
PPP4C-211ENST00000567642 NCAPD3P42695 1498 aa40.44■■■■■ 4.06
PPP4C-211ENST00000567642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.39■■■■■ 4.06
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCA2P51531 1590 aa40.32■■■■■ 4.05
PPP4C-211ENST00000567642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
PPP4C-211ENST00000567642 HMGXB3Q12766 1538 aa40.2■■■■■ 4.03
PPP4C-211ENST00000567642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
PPP4C-211ENST00000567642 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.03■■■■■ 4
PPP4C-211ENST00000567642 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.01■■■■■ 4
PPP4C-211ENST00000567642 ERCC6Q03468 1493 aa39.89■■■■□ 3.98
PPP4C-211ENST00000567642 NESP48681 1621 aa39.77■■■■□ 3.96
PPP4C-211ENST00000567642 CUX2O14529 1486 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-211ENST00000567642 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
PPP4C-211ENST00000567642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.54■■■■□ 3.92
PPP4C-211ENST00000567642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
PPP4C-211ENST00000567642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-211ENST00000567642 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-211ENST00000567642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.29■■■■□ 3.88
PPP4C-211ENST00000567642 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.25■■■■□ 3.87
PPP4C-211ENST00000567642 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.24■■■■□ 3.87
PPP4C-211ENST00000567642 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
PPP4C-211ENST00000567642 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.93■■■■□ 3.82
PPP4C-211ENST00000567642 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.86■■■■□ 3.81
PPP4C-211ENST00000567642 CFTRP13569 1480 aa38.86■■■■□ 3.81
PPP4C-211ENST00000567642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.84■■■■□ 3.81
PPP4C-211ENST00000567642 WDR62O43379 1518 aa38.81■■■■□ 3.8
PPP4C-211ENST00000567642 PRDM2Q13029 1718 aa38.66■■■■□ 3.78
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP4C-211ENST00000567642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
PPP4C-211ENST00000567642 TOPBP1Q92547 1522 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP4C-211ENST00000567642 ABCC8Q09428 1581 aa38.07■■■■□ 3.69
PPP4C-211ENST00000567642 IFT140Q96RY7 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-211ENST00000567642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
PPP4C-211ENST00000567642 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-211ENST00000567642 OSCARQ8IYS5 282 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-211ENST00000567642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
PPP4C-211ENST00000567642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM41Q8WV44 630 aa37.77■■■■□ 3.64
PPP4C-211ENST00000567642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
PPP4C-211ENST00000567642 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.623e-7■■■■■ 31.1
PPP4C-211ENST00000567642 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.64■■■■□ 3.62
PPP4C-211ENST00000567642 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
PPP4C-211ENST00000567642 CUX1P39880 1505 aa37.6■■■■□ 3.61
PPP4C-211ENST00000567642 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.58■■■■□ 3.61
PPP4C-211ENST00000567642 CHD1O14646 1710 aa37.54■■■■□ 3.6
PPP4C-211ENST00000567642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
PPP4C-211ENST00000567642 FBLN2P98095 1184 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-211ENST00000567642 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-211ENST00000567642 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-211ENST00000567642 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4C-211ENST00000567642 WDR97A6NE52 1622 aa37.4■■■■□ 3.58
PPP4C-211ENST00000567642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGEF11O15085 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
PPP4C-211ENST00000567642 GRIN2BQ13224 1484 aa37.23■■■■□ 3.55
PPP4C-211ENST00000567642 PBRM1Q86U86 1689 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-211ENST00000567642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
PPP4C-211ENST00000567642 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.16■■■■□ 3.54
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.15■■■■□ 3.54
PPP4C-211ENST00000567642 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.11■■■■□ 3.53
PPP4C-211ENST00000567642 TOP2BQ02880 1626 aa37.09■■■■□ 3.53
PPP4C-211ENST00000567642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.09■■■■□ 3.53
PPP4C-211ENST00000567642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.09■■■■□ 3.53
PPP4C-211ENST00000567642 SYNJ1O43426 1573 aa37.07■■■■□ 3.52
PPP4C-211ENST00000567642 SYNJ2O15056 1496 aa37.07■■■■□ 3.52
PPP4C-211ENST00000567642 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.04■■■■□ 3.52
PPP4C-211ENST00000567642 CLASP1Q7Z460 1538 aa37■■■■□ 3.51
PPP4C-211ENST00000567642 ARAP1Q96P48 1450 aa36.94■■■■□ 3.5
PPP4C-211ENST00000567642 ADAMTS12P58397 1594 aa36.8■■■■□ 3.48
PPP4C-211ENST00000567642 GRIN2AQ12879 1464 aa36.75■■■■□ 3.47
PPP4C-211ENST00000567642 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.7■■■■□ 3.47
PPP4C-211ENST00000567642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.68■■■■□ 3.46
PPP4C-211ENST00000567642 CEP170Q5SW79 1584 aa36.62■■■■□ 3.45
PPP4C-211ENST00000567642 NUP160Q12769 1436 aa36.59■■■■□ 3.45
PPP4C-211ENST00000567642 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
PPP4C-211ENST00000567642 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.48■■■■□ 3.43
PPP4C-211ENST00000567642 SHROOM2Q13796 1616 aa36.43■■■■□ 3.42
PPP4C-211ENST00000567642 KIF27Q86VH2 1401 aa36.37■■■■□ 3.41
PPP4C-211ENST00000567642 CUL7Q14999 1698 aa36.29■■■■□ 3.4
PPP4C-211ENST00000567642 IGF1RP08069 1367 aa36.28■■■■□ 3.4
PPP4C-211ENST00000567642 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.27■■■■□ 3.4
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