RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.14■□□□□ 0.17
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.43■□□□□ 0.06
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CCNDBP1-202ENST00000444658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15□□□□□ -0.01
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.95□□□□□ -0.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.87□□□□□ -0.03
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.86□□□□□ -0.03
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.82□□□□□ -0.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.79□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.77□□□□□ -0.04
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFT140Q96RY7 1462 aa14.77□□□□□ -0.04
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CCNDBP1-202ENST00000444658 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.73□□□□□ -0.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 WDR97A6NE52 1622 aa14.72□□□□□ -0.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCNDBP1-202ENST00000444658 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.69□□□□□ -0.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP162Q5TB80 1403 aa14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.67□□□□□ -0.06
CCNDBP1-202ENST00000444658 GRIN2BQ13224 1484 aa14.64□□□□□ -0.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 CUL7Q14999 1698 aa14.63□□□□□ -0.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 13.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLIP1P30622 1438 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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