Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RCAN1P53805 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCAN1P53805 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCAN1P53805 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms