Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SSFA2P28290 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SSFA2P28290 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SSFA2P28290 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms