Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCCD1A6NED2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCCD1A6NED2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms