Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KB2Q9UBS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS6KB2Q9UBS0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms