Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 AP000553.4-201ENST00000641967 471 ntBASIC10.84□□□□□ -0.673e-10■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.975e-21■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.477e-11■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.057e-11■■■■■ 47.8
SF3B4Q15427 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.337e-11■■■■■ 47.8
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SF3B4Q15427 TRPV1-205ENST00000570742 492 ntTSL 314.64□□□□□ -0.078e-12■■■■■ 47.7
SF3B4Q15427 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.57e-10■■■■■ 47.7
SF3B4Q15427 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 47.7
SF3B4Q15427 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.127e-10■■■■■ 47.7
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SF3B4Q15427 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 47.7
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SF3B4Q15427 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.021e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MRPL49-208ENST00000533943 688 ntTSL 314.67□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MRPL49-205ENST00000528529 752 ntTSL 314.33□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 CMIP-212ENST00000623842 2685 nt13.61□□□□□ -0.233e-11■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MRPL49-202ENST00000524482 2065 ntTSL 213.43□□□□□ -0.261e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 NUMB-209ENST00000554315 1740 ntTSL 1 (best)12.59□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 NUMB-215ENST00000555307 1039 ntTSL 512.55□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-20■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MRPL49-207ENST00000532671 2526 ntTSL 212.41□□□□□ -0.421e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 EZR-204ENST00000476189 956 ntTSL 310.67□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-20■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MADD-216ENST00000469699 924 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.841e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 LEMD3-202ENST00000539442 932 ntTSL 29.49□□□□□ -0.891e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 MADD-223ENST00000634938 658 ntTSL 58.3□□□□□ -1.081e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.122e-20■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 NUMB-210ENST00000554394 954 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 LEMD3-206ENST00000545026 619 ntTSL 36.09□□□□□ -1.431e-10■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 45.83□□□□□ -1.482e-20■■■■■ 47.3
SF3B4Q15427 NUMB-218ENST00000555859 906 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 47.3
Retrieved 100 of 47,349 protein–RNA pairs in 4965.3 ms