RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426047.1

CHTF18-203, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-203ENST00000426047 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.45■■■■□ 3.91
CHTF18-203ENST00000426047 ABCC9O60706 1549 aa36.83■■■■□ 3.49
CHTF18-203ENST00000426047 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.69■■■■□ 3.3
CHTF18-203ENST00000426047 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.44■■■■□ 3.26
CHTF18-203ENST00000426047 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-203ENST00000426047 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-203ENST00000426047 NACADO15069 1562 aa34.06■■■■□ 3.04
CHTF18-203ENST00000426047 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.05■■■■□ 3.04
CHTF18-203ENST00000426047 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.66■■■□□ 2.98
CHTF18-203ENST00000426047 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.52■■■□□ 2.96
CHTF18-203ENST00000426047 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.25■■■□□ 2.91
CHTF18-203ENST00000426047 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.24■■■□□ 2.91
CHTF18-203ENST00000426047 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.2■■■□□ 2.91
CHTF18-203ENST00000426047 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.13■■■□□ 2.89
CHTF18-203ENST00000426047 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.93■■■□□ 2.86
CHTF18-203ENST00000426047 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
CHTF18-203ENST00000426047 SCRIBQ14160 1630 aa32.59■■■□□ 2.81
CHTF18-203ENST00000426047 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.45■■■□□ 2.78
CHTF18-203ENST00000426047 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CHTF18-203ENST00000426047 CUX2O14529 1486 aa32.04■■■□□ 2.72
CHTF18-203ENST00000426047 ERCC6Q03468 1493 aa31.89■■■□□ 2.7
CHTF18-203ENST00000426047 TRIM41Q8WV44 630 aa31.51■■■□□ 2.63
CHTF18-203ENST00000426047 NCAPD3P42695 1498 aa31.49■■■□□ 2.63
CHTF18-203ENST00000426047 NESP48681 1621 aa31.35■■■□□ 2.61
CHTF18-203ENST00000426047 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.27■■■□□ 2.6
CHTF18-203ENST00000426047 SMARCA2P51531 1590 aa31.1■■■□□ 2.57
CHTF18-203ENST00000426047 HMGXB3Q12766 1538 aa31.09■■■□□ 2.57
CHTF18-203ENST00000426047 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CHTF18-203ENST00000426047 SMARCA4P51532 1647 aa30.95■■■□□ 2.54
CHTF18-203ENST00000426047 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
CHTF18-203ENST00000426047 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.88■■■□□ 2.53
CHTF18-203ENST00000426047 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.85■■■□□ 2.53
CHTF18-203ENST00000426047 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-203ENST00000426047 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CHTF18-203ENST00000426047 OSCARQ8IYS5 282 aa30.6■■■□□ 2.49
CHTF18-203ENST00000426047 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.59■■■□□ 2.49
CHTF18-203ENST00000426047 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.58■■■□□ 2.49
CHTF18-203ENST00000426047 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.54■■■□□ 2.48
CHTF18-203ENST00000426047 WDR62O43379 1518 aa30.47■■■□□ 2.47
CHTF18-203ENST00000426047 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-203ENST00000426047 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.29■■■□□ 2.44
CHTF18-203ENST00000426047 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.19■■■□□ 2.42
CHTF18-203ENST00000426047 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
CHTF18-203ENST00000426047 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
CHTF18-203ENST00000426047 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.14■■■□□ 2.41
CHTF18-203ENST00000426047 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CHTF18-203ENST00000426047 WIZO95785 1651 aa29.99■■■□□ 2.39
CHTF18-203ENST00000426047 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.99■■■□□ 2.39
CHTF18-203ENST00000426047 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CHTF18-203ENST00000426047 ARHGEF11O15085 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
CHTF18-203ENST00000426047 CFTRP13569 1480 aa29.93■■■□□ 2.38
CHTF18-203ENST00000426047 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CHTF18-203ENST00000426047 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CHTF18-203ENST00000426047 IFT140Q96RY7 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
CHTF18-203ENST00000426047 FBLN2P98095 1184 aa29.6■■■□□ 2.33
CHTF18-203ENST00000426047 ARAP1Q96P48 1450 aa29.6■■■□□ 2.33
CHTF18-203ENST00000426047 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
CHTF18-203ENST00000426047 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-203ENST00000426047 TOPBP1Q92547 1522 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-203ENST00000426047 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CHTF18-203ENST00000426047 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.45■■■□□ 2.315e-7■■■■■ 31.4
CHTF18-203ENST00000426047 CHD1O14646 1710 aa29.45■■■□□ 2.3
CHTF18-203ENST00000426047 PRDM2Q13029 1718 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-203ENST00000426047 ABCC8Q09428 1581 aa29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-203ENST00000426047 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.27■■■□□ 2.28
CHTF18-203ENST00000426047 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-203ENST00000426047 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-203ENST00000426047 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CHTF18-203ENST00000426047 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-203ENST00000426047 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CHTF18-203ENST00000426047 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHTF18-203ENST00000426047 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.09■■■□□ 2.25
CHTF18-203ENST00000426047 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-203ENST00000426047 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.05■■■□□ 2.24
CHTF18-203ENST00000426047 SOGA1O94964 1423 aa29.05■■■□□ 2.24
CHTF18-203ENST00000426047 SYNJ1O43426 1573 aa29.02■■■□□ 2.24
CHTF18-203ENST00000426047 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.94■■■□□ 2.22
CHTF18-203ENST00000426047 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CHTF18-203ENST00000426047 SYNJ2O15056 1496 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-203ENST00000426047 GRIN2BQ13224 1484 aa28.85■■■□□ 2.21
CHTF18-203ENST00000426047 WDR97A6NE52 1622 aa28.81■■■□□ 2.2
CHTF18-203ENST00000426047 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.81■■■□□ 2.2
CHTF18-203ENST00000426047 CUX1P39880 1505 aa28.61■■■□□ 2.17
CHTF18-203ENST00000426047 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.61■■■□□ 2.17
CHTF18-203ENST00000426047 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
CHTF18-203ENST00000426047 PBRM1Q86U86 1689 aa28.57■■■□□ 2.16
CHTF18-203ENST00000426047 CEP170Q5SW79 1584 aa28.47■■■□□ 2.15
CHTF18-203ENST00000426047 GRIN2AQ12879 1464 aa28.46■■■□□ 2.15
CHTF18-203ENST00000426047 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.46■■■□□ 2.15
CHTF18-203ENST00000426047 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.45■■■□□ 2.14
CHTF18-203ENST00000426047 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.42■■■□□ 2.14
CHTF18-203ENST00000426047 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.39■■■□□ 2.14
CHTF18-203ENST00000426047 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.38■■■□□ 2.13
CHTF18-203ENST00000426047 NUP160Q12769 1436 aa28.37■■■□□ 2.13
CHTF18-203ENST00000426047 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
CHTF18-203ENST00000426047 SHROOM2Q13796 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
CHTF18-203ENST00000426047 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CHTF18-203ENST00000426047 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.27■■■□□ 2.12
CHTF18-203ENST00000426047 ADAMTS12P58397 1594 aa28.25■■■□□ 2.11
CHTF18-203ENST00000426047 JPH4Q96JJ6 628 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms