RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.28■■■■□ 3.56
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.52■■■□□ 2.96
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC9O60706 1549 aa33.28■■■□□ 2.92
CHTF18-211ENST00000491530 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.57■■■□□ 2.64
CHTF18-211ENST00000491530 NACADO15069 1562 aa31.43■■■□□ 2.62
CHTF18-211ENST00000491530 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.29■■■□□ 2.6
CHTF18-211ENST00000491530 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.27■■■□□ 2.6
CHTF18-211ENST00000491530 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.2■■■□□ 2.59
CHTF18-211ENST00000491530 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.07■■■□□ 2.56
CHTF18-211ENST00000491530 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CHTF18-211ENST00000491530 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.55
CHTF18-211ENST00000491530 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.93■■■□□ 2.54
CHTF18-211ENST00000491530 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.72■■■□□ 2.51
CHTF18-211ENST00000491530 SCRIBQ14160 1630 aa30.38■■■□□ 2.45
CHTF18-211ENST00000491530 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.36■■■□□ 2.45
CHTF18-211ENST00000491530 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.01■■■□□ 2.39
CHTF18-211ENST00000491530 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.96■■■□□ 2.39
CHTF18-211ENST00000491530 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CHTF18-211ENST00000491530 SMARCA4P51532 1647 aa29.09■■■□□ 2.25
CHTF18-211ENST00000491530 NCAPD3P42695 1498 aa28.94■■■□□ 2.22
CHTF18-211ENST00000491530 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
CHTF18-211ENST00000491530 HMGXB3Q12766 1538 aa28.91■■■□□ 2.22
CHTF18-211ENST00000491530 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.91■■■□□ 2.22
CHTF18-211ENST00000491530 SMARCA2P51531 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
CHTF18-211ENST00000491530 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.88■■■□□ 2.21
CHTF18-211ENST00000491530 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.76■■■□□ 2.19
CHTF18-211ENST00000491530 ERCC6Q03468 1493 aa28.75■■■□□ 2.19
CHTF18-211ENST00000491530 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.73■■■□□ 2.19
CHTF18-211ENST00000491530 CUX2O14529 1486 aa28.65■■■□□ 2.18
CHTF18-211ENST00000491530 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CHTF18-211ENST00000491530 NESP48681 1621 aa28.55■■■□□ 2.16
CHTF18-211ENST00000491530 WIZO95785 1651 aa28.44■■■□□ 2.14
CHTF18-211ENST00000491530 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.33■■■□□ 2.12
CHTF18-211ENST00000491530 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CHTF18-211ENST00000491530 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CHTF18-211ENST00000491530 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.19■■■□□ 2.1
CHTF18-211ENST00000491530 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.14■■■□□ 2.1
CHTF18-211ENST00000491530 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CHTF18-211ENST00000491530 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.05■■■□□ 2.08
CHTF18-211ENST00000491530 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.91■■■□□ 2.06
CHTF18-211ENST00000491530 PRDM2Q13029 1718 aa27.91■■■□□ 2.06
CHTF18-211ENST00000491530 CFTRP13569 1480 aa27.85■■■□□ 2.05
CHTF18-211ENST00000491530 WDR62O43379 1518 aa27.83■■■□□ 2.05
CHTF18-211ENST00000491530 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.79■■■□□ 2.04
CHTF18-211ENST00000491530 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CHTF18-211ENST00000491530 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.76■■■□□ 2.03
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.67■■■□□ 2.02
CHTF18-211ENST00000491530 TRIM41Q8WV44 630 aa27.57■■■□□ 2
CHTF18-211ENST00000491530 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CHTF18-211ENST00000491530 OSCARQ8IYS5 282 aa27.36■■□□□ 1.97
CHTF18-211ENST00000491530 TOPBP1Q92547 1522 aa27.3■■□□□ 1.96
CHTF18-211ENST00000491530 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.3■■□□□ 1.96
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CHTF18-211ENST00000491530 IFT140Q96RY7 1462 aa27.22■■□□□ 1.95
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC8Q09428 1581 aa27.2■■□□□ 1.94
CHTF18-211ENST00000491530 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CHTF18-211ENST00000491530 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CHTF18-211ENST00000491530 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CHTF18-211ENST00000491530 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.02■■□□□ 1.92
CHTF18-211ENST00000491530 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.02■■□□□ 1.92
CHTF18-211ENST00000491530 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.02■■□□□ 1.92
CHTF18-211ENST00000491530 CUX1P39880 1505 aa27■■□□□ 1.91
CHTF18-211ENST00000491530 WDR97A6NE52 1622 aa26.97■■□□□ 1.91
CHTF18-211ENST00000491530 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 31.4
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF11O15085 1522 aa26.93■■□□□ 1.9
CHTF18-211ENST00000491530 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.91■■□□□ 1.9
CHTF18-211ENST00000491530 CHD1O14646 1710 aa26.88■■□□□ 1.89
CHTF18-211ENST00000491530 FBLN2P98095 1184 aa26.87■■□□□ 1.89
CHTF18-211ENST00000491530 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.86■■□□□ 1.89
CHTF18-211ENST00000491530 SOGA1O94964 1423 aa26.81■■□□□ 1.88
CHTF18-211ENST00000491530 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
CHTF18-211ENST00000491530 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.78■■□□□ 1.88
CHTF18-211ENST00000491530 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.78■■□□□ 1.88
CHTF18-211ENST00000491530 PBRM1Q86U86 1689 aa26.74■■□□□ 1.87
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.72■■□□□ 1.87
CHTF18-211ENST00000491530 TOP2BQ02880 1626 aa26.71■■□□□ 1.87
CHTF18-211ENST00000491530 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.69■■□□□ 1.86
CHTF18-211ENST00000491530 SYNJ1O43426 1573 aa26.68■■□□□ 1.86
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.66■■□□□ 1.86
CHTF18-211ENST00000491530 ARAP1Q96P48 1450 aa26.66■■□□□ 1.86
CHTF18-211ENST00000491530 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CHTF18-211ENST00000491530 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CHTF18-211ENST00000491530 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
CHTF18-211ENST00000491530 GRIN2BQ13224 1484 aa26.59■■□□□ 1.85
CHTF18-211ENST00000491530 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.55■■□□□ 1.84
CHTF18-211ENST00000491530 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CHTF18-211ENST00000491530 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.53■■□□□ 1.84
CHTF18-211ENST00000491530 SYNJ2O15056 1496 aa26.49■■□□□ 1.83
CHTF18-211ENST00000491530 ADAMTS12P58397 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
CHTF18-211ENST00000491530 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
CHTF18-211ENST00000491530 GRIN2AQ12879 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
CHTF18-211ENST00000491530 CEP170Q5SW79 1584 aa26.27■■□□□ 1.8
CHTF18-211ENST00000491530 NUP160Q12769 1436 aa26.22■■□□□ 1.79
CHTF18-211ENST00000491530 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.21■■□□□ 1.79
CHTF18-211ENST00000491530 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.21■■□□□ 1.79
CHTF18-211ENST00000491530 SHROOM2Q13796 1616 aa26.21■■□□□ 1.79
CHTF18-211ENST00000491530 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.16■■□□□ 1.78
CHTF18-211ENST00000491530 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.11■■□□□ 1.77
CHTF18-211ENST00000491530 CUL7Q14999 1698 aa26.1■■□□□ 1.77
CHTF18-211ENST00000491530 KIF27Q86VH2 1401 aa25.98■■□□□ 1.75
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