RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.29	■■■■■ 4.52
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCC9	O60706	1549 aa		39.65	■■■■□ 3.94
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.02	■■■■□ 3.84
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.65	■■■■□ 3.62
RNPS1-222	ENST00000567147	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.41	■■■■□ 3.58
RNPS1-222	ENST00000567147	NACAD	O15069	1562 aa		37	■■■■□ 3.51
RNPS1-222	ENST00000567147	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.92	■■■■□ 3.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.87	■■■■□ 3.49
RNPS1-222	ENST00000567147	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.68	■■■■□ 3.46
RNPS1-222	ENST00000567147	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.39	■■■■□ 3.42
RNPS1-222	ENST00000567147	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.24	■■■■□ 3.39
RNPS1-222	ENST00000567147	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.76	■■■■□ 3.32
RNPS1-222	ENST00000567147	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.75	■■■■□ 3.31
RNPS1-222	ENST00000567147	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.7	■■■■□ 3.31
RNPS1-222	ENST00000567147	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.67	■■■■□ 3.3
RNPS1-222	ENST00000567147	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.66	■■■■□ 3.3
RNPS1-222	ENST00000567147	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.62	■■■■□ 3.29
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.52	■■■■□ 3.28
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.83	■■■■□ 3.17
RNPS1-222	ENST00000567147	CUX2	O14529	1486 aa		34.23	■■■■□ 3.07
RNPS1-222	ENST00000567147	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.22	■■■■□ 3.07
RNPS1-222	ENST00000567147	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.16	■■■■□ 3.06
RNPS1-222	ENST00000567147	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.03	■■■■□ 3.04
RNPS1-222	ENST00000567147	NES	P48681	1621 aa		33.93	■■■■□ 3.02
RNPS1-222	ENST00000567147	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RNPS1-222	ENST00000567147	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RNPS1-222	ENST00000567147	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RNPS1-222	ENST00000567147	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
RNPS1-222	ENST00000567147	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
RNPS1-222	ENST00000567147	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
RNPS1-222	ENST00000567147	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RNPS1-222	ENST00000567147	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.47	■■■□□ 2.95
RNPS1-222	ENST00000567147	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RNPS1-222	ENST00000567147	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RNPS1-222	ENST00000567147	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RNPS1-222	ENST00000567147	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RNPS1-222	ENST00000567147	WIZ	O95785	1651 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR62	O43379	1518 aa		33.01	■■■□□ 2.87
RNPS1-222	ENST00000567147	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RNPS1-222	ENST00000567147	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RNPS1-222	ENST00000567147	CFTR	P13569	1480 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNPS1-222	ENST00000567147	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RNPS1-222	ENST00000567147	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RNPS1-222	ENST00000567147	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RNPS1-222	ENST00000567147	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RNPS1-222	ENST00000567147	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RNPS1-222	ENST00000567147	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RNPS1-222	ENST00000567147	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RNPS1-222	ENST00000567147	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
RNPS1-222	ENST00000567147	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RNPS1-222	ENST00000567147	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.16	■■■□□ 2.74
RNPS1-222	ENST00000567147	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RNPS1-222	ENST00000567147	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
RNPS1-222	ENST00000567147	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RNPS1-222	ENST00000567147	CHD1	O14646	1710 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RNPS1-222	ENST00000567147	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.94	■■■□□ 2.7
RNPS1-222	ENST00000567147	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.93	■■■□□ 2.7	3e-7	■■■■□ 22.2
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RNPS1-222	ENST00000567147	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
RNPS1-222	ENST00000567147	FBLN2	P98095	1184 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RNPS1-222	ENST00000567147	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
RNPS1-222	ENST00000567147	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RNPS1-222	ENST00000567147	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
RNPS1-222	ENST00000567147	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RNPS1-222	ENST00000567147	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
RNPS1-222	ENST00000567147	SOGA1	O94964	1423 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RNPS1-222	ENST00000567147	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RNPS1-222	ENST00000567147	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.57	■■■□□ 2.64
RNPS1-222	ENST00000567147	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.51	■■■□□ 2.63
RNPS1-222	ENST00000567147	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.49	■■■□□ 2.63
RNPS1-222	ENST00000567147	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.47	■■■□□ 2.63
RNPS1-222	ENST00000567147	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.43	■■■□□ 2.62
RNPS1-222	ENST00000567147	CUX1	P39880	1505 aa		31.41	■■■□□ 2.62
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.39	■■■□□ 2.62
RNPS1-222	ENST00000567147	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
RNPS1-222	ENST00000567147	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.36	■■■□□ 2.61
RNPS1-222	ENST00000567147	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RNPS1-222	ENST00000567147	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RNPS1-222	ENST00000567147	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RNPS1-222	ENST00000567147	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RNPS1-222	ENST00000567147	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.08	■■■□□ 2.57
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.06	■■■□□ 2.56
RNPS1-222	ENST00000567147	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.97	■■■□□ 2.55
RNPS1-222	ENST00000567147	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.93	■■■□□ 2.54
RNPS1-222	ENST00000567147	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.91	■■■□□ 2.54
RNPS1-222	ENST00000567147	NUP160	Q12769	1436 aa		30.86	■■■□□ 2.53
RNPS1-222	ENST00000567147	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.85	■■■□□ 2.53
RNPS1-222	ENST00000567147	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.8	■■■□□ 2.52
RNPS1-222	ENST00000567147	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.76	■■■□□ 2.51
RNPS1-222	ENST00000567147	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.75	■■■□□ 2.51
RNPS1-222	ENST00000567147	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.73	■■■□□ 2.51
RNPS1-222	ENST00000567147	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.73	■■■□□ 2.51
RNPS1-222	ENST00000567147	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.66	■■■□□ 2.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.65	■■■□□ 2.5
RNPS1-222	ENST00000567147	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.58	■■■□□ 2.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms