Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH3BGRP55822 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SH3BGRP55822 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 378.4 ms