Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCBP05771 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCBP05771 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCBP05771 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms