Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNTLNQ9NXG0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNTLNQ9NXG0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CNTLNQ9NXG0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CNTLNQ9NXG0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CNTLNQ9NXG0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CNTLNQ9NXG0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CNTLNQ9NXG0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CNTLNQ9NXG0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CNTLNQ9NXG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms