Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLMNQ96JQ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLMNQ96JQ2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLMNQ96JQ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms