Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC35A4Q96G79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC35A4Q96G79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC35A4Q96G79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms