Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAPPC11Q7Z392 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC11Q7Z392 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC11Q7Z392 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms