Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1I2Q13409 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DYNC1I2Q13409 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DYNC1I2Q13409 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms