RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.52■■■■■ 4.72
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.05■■■■□ 3.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.8■■■■□ 3.64
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.65■■■■□ 3.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.4■■■■□ 3.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC9O60706 1549 aa36.4■■■■□ 3.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCRIBQ14160 1630 aa35.75■■■■□ 3.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.58■■■■□ 3.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 NACADO15069 1562 aa35.44■■■■□ 3.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.27■■■■□ 3.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.08■■■■□ 3.21
UBE2Q1-201ENST00000292211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.19
UBE2Q1-201ENST00000292211 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.82■■■■□ 3.17
UBE2Q1-201ENST00000292211 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.6■■■■□ 3.13
UBE2Q1-201ENST00000292211 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.59■■■■□ 3.13
UBE2Q1-201ENST00000292211 WIZO95785 1651 aa34.37■■■■□ 3.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.35■■■■□ 3.09
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM41Q8WV44 630 aa34.32■■■■□ 3.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.3■■■■□ 3.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.04■■■■□ 3.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMARCA4P51532 1647 aa34.02■■■■□ 3.04
UBE2Q1-201ENST00000292211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.94■■■■□ 3.02
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.7■■■□□ 2.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.67■■■□□ 2.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMARCA2P51531 1590 aa33.58■■■□□ 2.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 HRCP23327 699 aa33.47■■■□□ 2.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC8Q09428 1581 aa33.43■■■□□ 2.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.37■■■□□ 2.93
UBE2Q1-201ENST00000292211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
UBE2Q1-201ENST00000292211 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.28■■■□□ 2.92
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
UBE2Q1-201ENST00000292211 SOGA1O94964 1423 aa33.01■■■□□ 2.88
UBE2Q1-201ENST00000292211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.88■■■□□ 2.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.85■■■□□ 2.85
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCAPD3P42695 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYNJ1O43426 1573 aa32.73■■■□□ 2.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 EEA1Q15075 1411 aa32.7■■■□□ 2.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 HMGXB3Q12766 1538 aa32.69■■■□□ 2.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.64■■■□□ 2.82
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP162Q5TB80 1403 aa32.56■■■□□ 2.8
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.52■■■□□ 2.8
UBE2Q1-201ENST00000292211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.8
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA3Q08378 1498 aa32.48■■■□□ 2.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYT1Q01538 1121 aa32.47■■■□□ 2.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFTRP13569 1480 aa32.36■■■□□ 2.77
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.36■■■□□ 2.77
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOP2BQ02880 1626 aa32.36■■■□□ 2.77
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.31■■■□□ 2.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUX1P39880 1505 aa32.24■■■□□ 2.75
UBE2Q1-201ENST00000292211 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.23■■■□□ 2.75
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.22■■■□□ 2.75
UBE2Q1-201ENST00000292211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.2■■■□□ 2.74
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF21BO75037 1637 aa32.17■■■□□ 2.74
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLIP1P30622 1438 aa32.15■■■□□ 2.74
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF27Q86VH2 1401 aa32.08■■■□□ 2.73
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
UBE2Q1-201ENST00000292211 APLP2Q06481 763 aa32.05■■■□□ 2.72
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
UBE2Q1-201ENST00000292211 NESP48681 1621 aa31.94■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 CUX2O14529 1486 aa31.92■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.92■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRDM2Q13029 1718 aa31.91■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRXQ9BXM0 1461 aa31.89■■■□□ 2.7
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.85■■■□□ 2.69
UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.84■■■□□ 2.69
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.8■■■□□ 2.68
UBE2Q1-201ENST00000292211 IGF1RP08069 1367 aa31.72■■■□□ 2.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
UBE2Q1-201ENST00000292211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.66■■■□□ 2.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.65■■■□□ 2.66
UBE2Q1-201ENST00000292211 TOPBP1Q92547 1522 aa31.59■■■□□ 2.65
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.56■■■□□ 2.64
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARAP1Q96P48 1450 aa31.55■■■□□ 2.64
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
UBE2Q1-201ENST00000292211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.51■■■□□ 2.63
UBE2Q1-201ENST00000292211 P3H3Q8IVL6 736 aa31.5■■■□□ 2.63
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.49■■■□□ 2.63
UBE2Q1-201ENST00000292211 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.44■■■□□ 2.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.42■■■□□ 2.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.38■■■□□ 2.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEUROD1Q13562 356 aa31.37■■■□□ 2.61
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.29■■■□□ 2.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms