Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRBP23467 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPRBP23467 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRBP23467 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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