Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PFDN6O15212 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFDN6O15212 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN6O15212 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms