Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM227AF5H4B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227AF5H4B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227AF5H4B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms