Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNL1Q8IU54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
IFNL1Q8IU54 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IFNL1Q8IU54 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IFNL1Q8IU54 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms