Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM220Q6QAJ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM220Q6QAJ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM220Q6QAJ8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms